1989年，铁人三项被原国家体育运动委员会列为在全国正式开展的运动项目之一。1990年1月16日中国铁人三项运动协会由国家体育运动委员会和中华全国体育总会批准在北京成立。同年，中国铁人三项运动协会加入了中国奥委会和国际铁人三项联盟。

中国铁人三项运动协会是在中华人民共和国民政部登记注册的非营利性的社会组织，是中华全国体育总会的团体会员，是中国奥林匹克委员会承认的全国性运动协会, 是世界铁联、亚洲铁人三项联合会认可的代表中国参加其活动的唯一合法组织。代表国家体育总局负责对中国大陆范围内铁人三项运动实施全面管理，包括项目推广与发展、人才培养、铁人三项国家集训队的组织与管理、全国以上级赛事组织与管理以及国际交流等等。